В мае 1999 года компания "СВсофт МФТИ", входящая в холдинг "SWsoft Holding Ltd" (с декабря 2007 года - "Parallels"), и Московский физико-технический институт создали совместный научно-исследовательский центр на базе вуза. Выбор учебного заведения был обусловлен тем, что среди сотрудников компании было достаточно большое количество выпускников МФТИ. Цель создания центра - приблизить высокий уровень подготовки студентов МФТИ к реальному современному производству лицензионного программного обеспечения, а также оказание со стороны компании всесторонней поддержки в развитии научных исследования в области разработки новых информационных технологий на уровне мировых стандартов. Основная задача центра заключается в получении студентами опыта реального промышленного программирования, путём организации и выполнении коллективных студенческих научно-исследовательских работ и проектов по большинству направлений кафедр МФТИ. При этом прохождение стажировки в центре не накладывает никаких обязательств на выпускников перед компанией в плане дальнейшего трудоустройства именно в СВсофт. За 7 лет такого сотрудничества многие из стажёров-выпускников центра стали сотрудниками компании, защитили кандидатские диссертации.
Осенью 2003 года компания "СВсофт Новосибирск", учитывая накопленный опыт, начала сотрудничество с Новосибирским государственным университетом, построение процесса обучения студентов в котором исторически имеет "корни" МФТИ. За сравнительно небольшой период времени компания помогла НГУ реконструировать, отремонтировать и оснастить компьютерными столами аудиторию для объединенной Европейско-Сибирской расширенной лаборатории научных медиа-ресурсов (JointLab) на 28 рабочих мест. Оборудовано две студенческие компьютерные лаборатории на 26 рабочих мест. СВсофт является спонсором круглогодичной подготовки сборных команд НГУ по программированию, участвующих в чемпионате мира ACM, а также поддерживает с 2004 года проведение Открытой Всесибирской олимпиады по программированию им. И.В.Поттосина. В апреле 2005 года компания стала генеральным спонсором заключительного этапа Всероссийской олимпиады школьников по информатике, проводимого на базе НГУ, которая впервые проходила в Новосибирске.
В апреле 2004 года при поддержке компании в помещении компьютерного класса ФИТ НГУ была открыта как пилотный проект на некоммерческой основе первая совместная студенческая учебная лаборатория НГУ-МФТИ-СВсофт на 7 рабочих мест под руководством доцента Факультета информационных технологий НГУ Дмитрия Иртегова. Стажировалось около 20 студентов. 10 декабря 2005 года лаборатория справила новоселье в собственном новом помещении на 16 рабочих мест. Тогда же состоялось официальное открытие совместной учебно-научной лаборатории НГУ-МФТИ-СВсофт, стажировку в которой проходит 40 студентов ФИТ, а также некоторых профильных кафедр ММФ, ФФ. К научному руководству студентами привлекаются преподаватели НГУ, а также сотрудники институтов СО РАН и компании. Темы проектов совместной учебно-научной лаборатории в основном предлагаются самими студентами, а также научными руководителями. Сейчас выполняется 12 таких проектов. Во время летних каникул 2004 и 2005 годов были организованы и проведены на базе НГУ при финансовой поддержке СВсофт две совместные летние школы для студентов. В июне 2004 года подписано соглашение между НГУ, МФТИ и СВсофт о создании научно-исследовательской лаборатории в составе НИЧ НГУ для студентов старших курсов и аспирантов НГУ. 1 июля 2005 года такая лаборатория была открыта. В настоящий момент в рамках хоздоговора выполняется проект по заказу компании. Готовится к подписанию ещё один договор.
За последние два года количество сотрудников компании выросло в пять раз, среди них примерно 45% - это выпускники НГУ. Компания сделала большой скачок в своем развитии, в 2005 году открыла второй офис в центре Новосибирска, и уже к весне 2006 года планируется открытие нового офиса в Академгородке.
Генеральный директор компании "СВсофт Новосибирск" А. Г. Ловейко (выпускник ФМШ, ММФ НГУ) подчеркнул, что при организации сотрудничества с НГУ учитывался не только острый недостаток квалифицированных специалистов на современном рынке труда, но также важность "отдачи долгов родному университету". Университет, когда-то вложивший в студентов множество навыков и давший возможность развиваться практически в любом направлении, теперь получает отдачу от своих выпускников. Именно это является первопричиной. Ректор НГУ Н. C. Диканский отметил в своём выступлении на официальном открытии совместной учебно-научной лаборатории НГУ-МФТИ-СВсофт, что в последнее время начинает проявляться социальная ответственность компаний. ООО "СВсофт в Новосибирске", в свою очередь, является достойным примером. Он подчеркнул всю важность "обратной связи", когда выпускники имеют желание и возможность содействовать развитию родного университета, и поблагодарил представителей компании за помощь.
В 2015 году подразделения, занимающиеся автоматизацией облачных сервисоы, были выделены в компанию Odin